Прежде «ДЭС» была частью Управления автомобильных дорог и транспорта, подведомственного краевому Минтрансу. Денис Курышев руководил Управлением после того, как 9 сентября 2022 года покинул пост в районной администрации.
О планируемой реорганизации Управления автомобильных дорог и транспорта и выделении из него отдельного учреждения КГБУ «ДЭС» сообщалось еще в мае 2024 года. Это объяснялось необходимостью уменьшения финансовых затрат и решения проблемы дефицита дорожных рабочих в регионе.